У Словниках онлайн (Орфографічний словник) знаходимо:
ВІДМІНОК ОДНИНА МНОЖИНА
Називний - хвороба, хвороби.
Родовий - хвороби, хвороб.
Давальний - хворобі, хворобам.
Знахідний - хворобу, хвороби.
Орудний - хворобою, хворобами.
Місцевий - хворобі, на/у хворобах.
Кличний - хворобо, хвороби.
Отже, правильно: Р. В. мнж. слова "хвороба" - хвороб.
Також знаходимо у Культура \ Мова \ Проблеми мови таке:
2.??? хвороб чи хворіб
В сполученнях -оро-, -оло-, -ере-, -еле- (т.зв. "повноголосся": голос,
мороз, шелест, очерет) о, е переходять в і:
1) у родовому відмінку множини іменників жіночого роду (здебільшого з
рухомим наголосом) і в похідних від них іменниках на -к(а) зі
значенням зменшеності: борода- борід- борідка, голова- голів- голівка
(і головка- з іншим значенням), сторона- сторін- сторінка. 2) у
родовому відмінку множини іменників здебільшого середнього роду й
відповідних зменшених іменниках: болото- боліт- болітце, ворота-
воріт- ворітця, долото- доліт- долітце, але: дерево- дерев- деревце,
джерело- джерел- джерельце;
Винятки: a. поріг, моріг, оборіг, сморід;
Чергування о, е з і не відбувається:
О, е в закритому складі не переходять в І 1) у повноголосних формах
-оро-, -оло- ере-, -еле зі сталим наголосом іменників переважно жіночого роду, від яких немає зменшених форм з і: колоди -колод
(колодка), долоні - долонь (долонька); сороки - сорок, огорожі -
огорож, нагорода - нагород
Іменник "хвороба" -ж.р.,сталий наголос,"О, е в закритому складі не переходять в І 1) у повноголосних формах -оро-, -оло- ере-, -еле зі сталим наголосом іменників переважно жіночого роду, від яких немає зменшених форм ".
А помилково вживають, тому що, відміняють за аналогією до "боліт, воріт" і інших, не враховуючи інших мовних нюансів.